Klonarkiven har två viktiga uppgifter: att odla säkerhetskopior av växterna i genbanken och att visa upp och berätta om genbanksväxterna. På genbanksfälten i Alnarp odlas i regel två plantor av samma accession (ett annat namn för sort eller insamling). För att inte riskera att någon accession dör eller försvinner på annat sätt, skickas också två plantor av samma insamling till ett lokalt klonarkiv. Skulle något hända med växterna i genbanken i Alnarp kan personalen i genbanken då få tillbaka plantor från det lokala klonarkivet och vice versa. Växterna är fördelade landskapsvis, så att accessioner insamlade på Öland bevaras vid Capellagården på Öland, växter som samlats in i Dalarna bevaras på Kulturreservatet Stabergs bergsmansgård utanför Falun och så vidare.
De lokala klonarkiven visar också upp accessionerna och berättar om dem för besökare, till exempel med hjälp av skyltar, ljudfiler eller guidade visningar. Till de lokala klonarkiven ska besökare kunna komma och studera och ta del av de olika regionernas trädgårdsväxthistoria.
Idag har Nationella genbanken avtal med 24 trädgårdar runt om i Sverige som visar upp och berätta om köks- och prydnadsväxterna i genbanken, ofta i en historisk trädgårdsmiljö. Som odlingsvärdar för de lokala klonarkiven fungerar museer, botaniska trädgårdar, trädgårdsskolor och kommunala anläggningar. Nedanstående lista presenterar de lokala klonarkiven för köks- och prydnadsväxter, från norr till söder:
Lapplands kulturbotaniska trädgård
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Lappland
Umeå länsresidens
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Norrbotten, Västerbotten, Ångermanland och Medelpad
Arboretum Norr
Klonarkiv för rosor från Norrbotten, Västerbotten, Ångermanland och Medelpad
Jamtli
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Jämtland och Härjedalen
Wij Trädgårdar
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Gästrikland och Hälsingland
Kulturreservatet Stabergs bergsmansgård
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Dalarna
Uppsala kommun
Klonarkiv för rosor från Uppland
Linnés Hammarby
Klonarkiv för rosor från Uppland
Vallby Friluftsmuseum
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Västmanland
Bergianska trädgården
Klonarkiv för köksväxter, perenner, lökar och knölar från Uppland
Rosendals Trädgård
Klonarkiv för rosor från Stockholm
Julita gård
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Södermanland
Universitetsparken Mariestad
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Skaraborgs län och Värmland
Gamla Linköping
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Östergötland
Rosenlund i Jönköping
Klonarkiv för rosor från Småland
Trädgårdsföreningen, Göteborgs Stad
Klonarkiv för rosor från Västra Götaland
Göteborgs botaniska trädgård
Klonarkiv för köksväxter, perenner, lökar och knölar från Västra Götaland
DBW:s Botaniska trädgård
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Gotland
Munkagårdsgymnasiet i Tvååker
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Halland
Huseby Bruk
Klonarkiv för köksväxter, perenner, lökar och knölar från Småland och Blekinge
Capellagården
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Öland
Fredriksdal museer och trädgårdar
Klonarkiv för köksväxter, perenner, rosor, lökar och knölar från Skåne
Botaniska trädgården, Lunds universitet
Klonarkiv för köksväxter, perenner, lökar och knölar från Skåne
Rosentorget Simrishamn
Klonarkiv för rosor från Skåne