Julia Bergholm

Jag är doktorand i biomedicinska vetenskaper (virologi) vid HBio. Mitt doktorandprojekt är ett samarbete med Addis Ababa Universitetet i Etiopien där vi undersöker patogener i unga idisslare som lider av diarré. Etiopien har Afrikas största population av boskapsdjur och diarrésjukdom är en av de främsta orsakerna till död bland kalvar, lamm och killingar. I projektet så kommer prov tas från både friska och sjuka djur och analyseras för olika patogener. Proverna kommer även undersökas med en djupare analys, viral metagenomik, som ger en komplett bild av viromet och möjligheten att potentiellt kunna upptäcka helt nya, eller nya varianter av virus. Projektet inkluderar fältarbete tillsammans med olika molekylära metoder i labb, samt bioinformatisk analys. Att kombinera och vara en del av alla de olika delarna i projektet är både en fantastisk möjlighet och otroligt lärorikt! 
 
Innan mina doktorandstudier så tog jag examen inom medicinska vetenskaper på Uppsala Universitet (Masterprogrammet i Infektionsbiologi) och jobbade sedan som infektionsbiolog på Akademiska Sjukhuset med sekvensering av SARS-CoV-2, där vi använde oss av sekvenseringsmetoden Nanopore. 

Improving animal and human health via identification and characterization of diarrhoeal pathogens in ruminants in Ethiopia

Master of Medical Science, 2019-2021, Uppsala University

Bachelor of Science, 2016-2019, Uppsala University 

Bergholm, J., Tessema, T.S., Blomström, AL., Berg, M. Detection and molecular characterization of major enteric pathogens in calves in central Ethiopia. BMC Vet Res20, 389 (2024). https://doi.org/10.1186/s12917-024-04258-7

Wasberg, A., Faria, I.R., Bergholm, J. et al. Assessing compatibility and viral fitness between poultry-adapted H9N2 and wild bird-derived neuraminidases. Sci Rep 13, 4476 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-023-31653-1

Mannsverk, S., Bergholm, J., Palanisamy, N. et al. SARS-CoV-2 variants of concern and spike protein mutational dynamics in a Swedish cohort during 2021, studied by Nanopore sequencing. Virol J 19, 164 (2022). https://doi.org/10.1186/s12985-022-01896-x

Martinell M, Andersson T, Mannsverk SS, Bergholm J, Ellström P, Hill A, Lindh J, Kaden R. In-Flight Transmission of a SARS-CoV-2 Lineage B.1.617.2 Harbouring the Rare S:E484Q Immune Escape Mutation. Viruses. 2022; 14(3):504. https://doi.org/10.3390/v14030504