Niclas Högberg

Jag arbetar som forksare vid enheten för veterinärmedicinsk epidemiologi. Fokus i min forskning ligger på precisionsdjurhållning och användandet av olika typer av sensorteknik för monitorering av djurhälsa och djurvälfärd.

Jag försvarade min avhandling "Sensing the worms – Automated behaviour monitoring for detection of parasitim in grazing livestock" under våren 2021. Vi undersökte om infektioner med mag-tarmparasiter påverkar beteendemönster på gruppnivå hos nötkreatur och lamm och om avvikelser hos infekterade individer kan registreras med sensorer.

Efter disputationen har jag fortsatt arbeta med olika projekt som fokuserar på precisionsdjurhållning hos både mjölkkor och betesdjur. 

Jag är involverad i epidemiologiundervisningen för veterinärstudenter, samt föresläser inom precisionslantbruk för olika kurser och program på SLU.

Pågeånde forskningsprojekt
Jag arbetar i dagsläget främst inom två pågående projekt.

Visionary Welfare Assessment (ViWA) - Välfärdsmonitorering med multisensorteknologi och datorseende (Formas 2021-02254). Jag är WP-ledare för delen av projektet som fokuserar på den tekniska utvecklingen av ett datorseendesystemet och dess tillämpning och validering. Fokus i utvecklingen ligger på utveckling och implementering av ett 3D-pose system för att utvärdera beteende och välfärd hos mjölkkor.
Medverkande partners: SLU, Sony Nordic, Högskolan Dalarna, RISE, Växa. 

DigiBrush: Ökade insikter om mjölkkors användning av borstar genom utveckling av automatiserade utvärderingsmetoder. (Formas: 2024-00336).
Detta tvärvetenskapliga projekt kommer att utveckla och validera state-of-the-art metoder, baserade på datorseende och sensordata om lokalisation, för att monitorera borstanvändning. Longitudinella studier kommer utvärdera hur gårdsstruktur och interna faktorer såsom laktationsstadie, sjukdom och stress påverkar användningen av borstar. Prediktiva modeller för att identifiera sjukdomar baserat på mönster i borstanvändningen kommer att utforskas. Slutligen kommer befintliga riktlinjer att sammanställas. Enkätstudier kommer att undersöka implementering på gårdsnivå samt drivkrafter och hinder hos lantbrukare för att installera borstar. Detta kommer att lägga grunden för validerade riktlinjer för best practice, förbättra metoderna för välfärdsbedömning och främja utvecklingen av automatiserad hälsoövervakning inom mjölkproduktionen.
Medverkande partners: SLU, Sony Nordic, DeLaval, University of Veterinary Medicine Vienna, Natural Resources Institute Finland – Luke & University of British Columbia.

Forskningsanslag

1. DigiBrush - Creating insight on brush use in dairy cows through the development of automated assessment methods. Funder: Formas. Main applicant: Niclas Högberg. Budget: 6 114 844 SEK (2025-2028).
2. Sustainable anthelmintic usage for Swedish beef- and milk production. Funder: SLF. Main applicant: Peter Halvarsson. Co-applicants: Niclas Högberg, Virpi Welling, Katinca Fungbrant, Mikael Juremalm. Budget: 2 960 000 SEK (2024-2026).
3. Are Swedish cows cool enough? Funder: Seydlitz MP bolagen. Main applicant: Renée Båge. Co-applicants: Niclas Högberg, Lena-Mari Tamminen. Budget: 4 000 000 SEK (2024-2028).
4. Maximising the usefulness of sensors for a successful transition period in dairy cows. Funder: SLF. Main applicant: Nils Fall. Co-applicants: Niclas Högberg, Lena-Mari Tamminen, Ilka Klaas. Budget: 2 492 000 SEK (2024-2028).
5. Improved animal welfare during mastitis through vaccination. Funder: Seydlitz MP bolagen. Main applicant: Josef Dahlberg: Co-applicant: Niclas Högberg, Caroline Fossum, Claudia Lutzelschwab: Budget: 1 000 000 SEK (2024-2025).
6. Improving research on dairy cow welfare and social interactions by mapping location data. Funder: Valborg Jacobssons Fond. Main applicant: Niclas Högberg. Co-applicants: Sigrid Agenäs, Lars Rönnegård. Budget: 200 000 SEK (2023).
7. Improving research on dairy cow welfare and social interactions by mapping location data. Funder: Petra Lundbergs Stiftelse. Main applicant: Niclas Högberg. Co-applicants: Sigrid Agenäs, Lars Rönnegård. Budget: 150 000 SEK (2023).
8. Animal protection and welfare monitoring using multi-sensor technology and computer vision. Funder: Formas. Main applicant: Ulf Emanuelson. Co-applicants: Niclas Högberg, Marc Ahlse, Elin Hernlund, Per Nielsen, Gabriela Olmos Antillón, Lars Rönnegård, Lena-Mari Tamminen, Louise Winblad. Budget: 7 957 453 SEK (2022-2025).
9. Smarter Electronic Systems for Animal Health Monitoring with Multisensor-assisted ML. Funder: Vinnova (2020-03712). Main applicant: Marc Ahlse. Co-applicants: Niclas Högberg, Ulf Emanuelson, Lars Rönnegård, Per Peetz Nielsen: 397 560 SEK (2020).

Inom pågående projekt har jag pågående samarbeten med:

Sony Nordic, DeLaval, Högskolan Dalarna, RISE, Växa, University of British Columbia, University of Veterinary Medicine Vienna, Natural Resources Institute Finland – Luke, University of Copenhagen, Research Institute of Farm Animal Biology (FBN).

Veterinärexamen, SLU, Uppsala, 2013

Veterinärmedicine doktor, Institutionen för biomedicin och veterinär folkhälsovetenskap, SLU, 2021

Handledning doktorander:
Adrien Kroese, (Technology; year of admission: 2022). Project title: Can we automate animal welfare monitoring with 3D pose estimation. Main supervisor: Prof. Nils Fall. Co-supervisors: Niclas Högberg, Lena-Mari Tamminen and Moudud Alam.

Anna Leclercq, (Veterinary Medicine; year of admission: 2022). Project title: Exploring the kinematics of lameness in dairy cows. Main supervisor: Elin Hernlund and Marie Rhodin (Changed from Marie Rhodin during year 2 (after E.H. became docent)). Co-supervisors: Niclas Högberg, Pia Haubro Andersen and Filipe Serra Braganca.

Boris Zandona, (Animal Science; year of admission: 2024). Project title: Maximizing the usefulness of sensors for a successful transition period in dairy cows. Main supervisor: Prof. Nils Fall. Co-supervisors: Niclas Högberg, Lena-Mari Tamminen, Ilka Klaas and Moudud Alam.

Anton de Jong, (Animal Biosciences; year of admission: 2024). Project title: Sustainable anthelmintic usage for Swedish beef- and milk production. Main supervisor: Eva Tyden. Co-supervisor: Niclas Högberg and Peter Halvarsson.

Karin Berggren, (Veterinary Medicine; year of admission: 2025). Project title: Effect of Fans and Water Cooling on Dairy Cow Health and Production under Swedish Conditions. Main supervisor: Prof. Renée Båge. Co-supervisors: Niclas Högberg and Lena-Mari Tamminen.

Handledning masterstudenter:
Mathilda Petersson, (Veterinary Medicine, SLU, 2022). Gastrointestinal nematode infection of lambs – associtation with deworming and age of weaning. Main supervisor: Niclas Högberg.

Sara Andersson, (Veterinary Medicine, SLU, 2022). Objective assessment of movement in dairy cows with clinical front leg lameness. Main supervisor: Niclas Högberg. 

Josefin Norraback, (Animal Science, University of Helsinki, 2021). Effekten av nematodinfektion på aktivitet och beteende hos förstagångsbetande lamm. Main supervisor: Niclas Högberg.

Reza Derakhshan, (Microdata Analysis, Dalarna University, 2024). Body Rumen Fill Scoring of Dairy Cows Using Digital Images. Main supervisor: Moudud Alam. Co-supervisor: Niclas Högberg.

Soroush Yousefzadeh Boroujeni, (Microdata Analysis, Dalarna University, 2024). Body Rumen Fill Scoring of Dairy Cows Using Digital Images. Main supervisor: Moudud Alam. Co-supervisor: Niclas Högberg.

Saumya Gupta, (Microdata Analysis, Dalarna University, 2023). Body dirtiness scoring from digital images of the dairy cow. Main supervisor: Moudud Alam. Co-supervisors: Niclas Högberg, Marc Ahlse.

Eric Jonsson, (Information Technology, Uppsala University, 2022). Automated Welfare Assessment of Dairy Cattle using Artificial Intelligence. Main supervisor: Marc Ahlse. Co-supervisor: Niclas Högberg.

Kroese, A.H., Högberg, N., Diaz Vicuna, E., Berthet, D., Fall, N., Alam, M., Tamminen, L.-M., 2024. Evaluating the Automation of Abnormal Posture Transition Indicators in Dairy Cows Using Pose Estimation in 3d. Smart Agricultural Technology (under review). https://doi.org/10.2139/ssrn.5049293

Kroese, A., Alam, M., Hernlund, E., Berthet, D., Tamminen, L.-M., Fall, N., Högberg, N., 2024. 3D pose estimation to detect posture transition in free-stall housed dairy cows. J. Dairy Sci. https://doi.org/10.3168/jds.2023-24427.

Guzhva, O., Hessle, A., Högberg, N., Lidfors, L., Höglund, J., 2024. Hide ‘n seek: individual behavioural responses of cattle excreting different amounts of nematode eggs—potential threshold for pasture contamination assessment. Front. Anim. Sci. 5.

Herlin, A., Brunberg, E., Hultgren, J., Högberg, N., Rydberg, A., Skarin, A., 2021. Animal Welfare Implications of Digital Tools for Monitoring and Management of Cattle and Sheep on Pasture. Animals 11, 829. https://doi.org/10.3390/ani11030829
Highlighted by Elsevier in a press release: https://www.elsevier.com/about/press-releases/automated-3d-computer-vision-model-offers-a-new-tool-to-measure-and

Högberg, N., Hessle, A., Lidfors, L., Höglund, J., 2023. The effect of weaning age on animal performance in lambs exposed to naturally acquired nematode infections. Vet. Parasitol. 316, 109900. https://doi.org/10.1016/j.vetpar.2023.109900

Högberg, N., Lidfors, L., Hessle, A., Arvidsson Segerkvist, K., Herlin, A., Höglund, J., 2019. Effects of nematode parasitism on activity patterns in first-season grazing cattle. Vet. Parasitol. 276, 100011. https://doi.org/10.1016/j.vpoa.2019.100011