Förbättring av djur- och humanhälsan genom att identifiera infektionsämnena bakom diarrésjukdomar hos unga idisslare i Etiopien

Bakgrund till projektet

Etiopien är ett land som ligger strax under Saharaöknen (sub-Saharan), med en befolkning på 100 miljoner människor. Landet lider ofta av torka som gör att människor och djur inte kan få tillräckligt med mat och vatten. Därför räknas Etiopien till ett av de allra fattigaste länderna i världen. Många är beroende av sina husdjur för mat och inkomst, speciellt har många bönder får och getter, men även kor är mycket vanliga. Etiopien beräknas ha den största populationen av får, getter och kor i Afrika och boskapshållning räknas som den viktigaste näringen i landet.

Tyvärr är det många problem med denna näring och till exempel dör mängder av djur på grund av smittsamma sjukdomar. Diarrésjukdomar anses vara ett av de största problemen. Diarrésjukdomar kan, förutom olika miljöfaktorer, orsakas av en mängd olika typer av mikroorganismer som virus, bakterier och protozoer. Hur dessa smittar varierar och även behandlingen skiljer sig åt, till exempel fungerar inte antibiotika mot virus. Väldigt ofta finns varken vaccin eller andra behandlingsmetoder tillgängliga.

Man har aldrig gjort någon ordentlig kartläggning över vilka mikroorganismer som ligger bakom diarrésjukdomar hos boskap i Etiopien. Därför kan man inte heller sätta in lämpliga åtgärder som till exempel vaccination eller lämpliga biosäkerhetsåtgärder. Inte heller har man undersökt om dessa mikroorganismer kan smitta mellan djuren och människorna, och vice versa.

Detta projekts övergripande mål har därför målsättningen att kartlägga vilka mikroorganismer som cirkulerar i får, getter och kor med diarré. Vi kommer också undersöka i detalj några virus och bakterier som är av speciellt intresse och följa upp om dessa även finns hos barn med diarré.

Dessutom har vi, och kommer fortsättningsvis, använda metoder som kan hitta helt nya mikroorganismer (s.k. metagenomik) och vi kommer även studera dessa nya mikroorganismer i mer detalj. Vi tror nämligen att det finns många ännu ej beskrivna virus/bakterier som orsak till diarrésjukdomar hos idisslarna. Detta har bekräftats av våra hittillsvarande data (manus under bearbetning).

När vi sedan har fått en så komplett bild som möjligt kommer vi avsluta projektet med en workshop där vi delar med oss av denna kunskap till organisationer med ansvar för djur, human hälsa och smittskydd i Etiopien, som i sin tur får inleda korttids- och långtidsåtgärder för att kontrollera och behandla dessa. Allt detta kommer leda till betydligt friskare djur och därmed förbättrad hälsa, reducera hunger och fattigdomen för barnen i Etiopien. 

Foto: Julia Bergholm

Framsteg i projektet

Projektet inleddes med ett fältarbete under vintern 2023 då prover från kalvar med och utan diarré samlades in. De första resultaten från studien har publicerats i en artikel (se nedan). Sammanfattningsvis var den huvudsakliga upptäckten att olika arter av Cryptosporidium, E. coli K99 +, samt de enteropatogena virusen Rotavirus A och bovint coronavirus cirkulerar i kalvar i Etiopien. Dessutom fann vi en ytterst ovanlig typ av rotavirus A, nämligen G24 och en variant av bovint coronavirus som vanligtvis finns hos kameldjur.

Under hösten 2024 håller vi på att analysera viral metagenomikdata och har hittat ett stort antal virus bland kalvarna som kan tänkas ha betydelse (manuskript under bearbetning).

Om politiska situationen förbättras, planeras insamling av lamm och killingar med och utan diarré under hösten 2025.