En av de viktiga generna för produktionen av pigment kallas för Melanokortin 1 receptorn (Mc1r). Ett annat namn för samma gen är Extension-genen och i litteraturen brukar man benämna varianterna av genen (alleler) som ett stort E (dominant) eller ett litet e (recessiv) . En tredje variant av genen har fått beteckningen Em och är förknippad med en så kallad melanistisk mask som förekommer hos bland annat boxer och schäfer. Em är en dominant egenskap och hundar med melanistisk mask kan därför ha både en och två kopior av allelen Em. Ett genetiskt test för Em visar om hunden bär på en eller två kopior av allelen.
En labrador eller flat coated retriever som har stort E på båda kromosomerna (E/E) eller en av kromosomerna (E/e) är svart eller brun. En gul hund har alltid två varianter av allelen litet e (e/e).
Det svarta melaninet, eumelanin kan ”spädas ut” av en annan gen ”Tyrosinase-Related Protein 1” (TYRP1) och ge brun pälsfärg. Det gul/röd pigmentet, feomelanin påverkas inte. Den dominanta vildtypen av Tyrp1-genen hos hundar benämns med stort B och ger svart pälsfärg hos bland annat labrador och flat coated retriver om hunden också har minst ett stort E.
Om hunden istället har två uppsättningar av den recessiva allelen litet b, blir pälsfärgen brun . Det finns åtminstone tre alleler av den recessiva b-allelen (bS, bd, bc). Hos vissa hundraser förekommer samtliga alleler.