Projektet syftar till att beskriva de mönster av genetisk diversitet och koppling man kan förvänta sig omkring anlag under balanserande selektion på grund av heterozygotfördel, för att hjälpa oss bättre tolka genomiska data när det finns balanserande selektion.
Simulering av de genomiska konsekvenserna av balanserande selektion
Mål
Projektet syftar till att beskriva de mönster av genetisk diversitet och koppling man kan förvänta sig omkring anlag under balanserande selektion på grund av heterozygotfördel, för att hjälpa oss bättre tolka genomiska data när det finns balanserande selektion.
Bakgrund
Balanserande selektion på grund av heterozygot fördel inträffar när samma genetiska variant har både skadliga och gynnsamma effekter, så att heterozygoten har högst fitness. Sådan selektion kan driva skadliga recessiva anlag till hög allelfrekvens, vilket kan orsaka stora problem i husdjurspopulationer. Frågan är hur man bäst detekterar sådan selektion, och om den lämnar en karaktäristisk signatur i genomet.
Projektbeskrivning
Projektet kommer att använda genetisk simulering för att undersöka den genomiska signaturen kring en allel under balanserande selektion med heterozygot fördel. Genom att följa allelen efter att den introducerats och under många generationer kan man se effekterna på lång och kort sikt. De genetiska parameterna kan varieras för att studera effekten av selektionens styrka, populationsstorlek och rekombination.
Specifiktationer
Lämpligt för: Husdjursvetenskap, Bioinformatik, eller en student inom veterinärprogrammet.
